MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli 042 plasmid pAA

Total Repeats: 2345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017627	CAA	2	6	25	30	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387604869
2	NC_017627	TGC	2	6	209	214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387604869
3	NC_017627	GCT	2	6	234	239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387604869
4	NC_017627	CAC	2	6	294	299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387604869
5	NC_017627	TACC	2	8	402	409	25 %	25 %	0 %	50 %	387604869
6	NC_017627	CCGA	2	8	445	452	25 %	0 %	25 %	50 %	387604869
7	NC_017627	GCC	2	6	478	483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387604869
8	NC_017627	GC	3	6	514	519	0 %	0 %	50 %	50 %	387604869
9	NC_017627	ACAG	2	8	542	549	50 %	0 %	25 %	25 %	387604869
10	NC_017627	CAGA	2	8	637	644	50 %	0 %	25 %	25 %	387604869
11	NC_017627	GCGTGC	2	12	666	677	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387604869
12	NC_017627	CGT	2	6	679	684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387604869
13	NC_017627	CGT	2	6	799	804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387604869
14	NC_017627	CCT	2	6	877	882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017627	AAT	2	6	886	891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017627	A	7	7	939	945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017627	A	7	7	960	966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017627	TCA	2	6	972	977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017627	CGG	2	6	1031	1036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017627	GCA	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017627	TCGC	2	8	1154	1161	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017627	GCA	2	6	1178	1183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017627	TAA	2	6	1286	1291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017627	TAT	2	6	1296	1301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017627	T	8	8	1301	1308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017627	T	6	6	1328	1333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017627	TAA	2	6	1391	1396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017627	AGT	2	6	1402	1407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387604870
29	NC_017627	ATT	2	6	1463	1468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604870
30	NC_017627	T	6	6	1506	1511	0 %	100 %	0 %	0 %	387604870
31	NC_017627	GAAA	2	8	1525	1532	75 %	0 %	25 %	0 %	387604870
32	NC_017627	ATT	2	6	1567	1572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604870
33	NC_017627	TAT	2	6	1675	1680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604870
34	NC_017627	A	7	7	1771	1777	100 %	0 %	0 %	0 %	387604870
35	NC_017627	TAT	2	6	1790	1795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604870
36	NC_017627	ATA	2	6	1802	1807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387604870
37	NC_017627	TAA	2	6	1819	1824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387604870
38	NC_017627	TCG	2	6	1876	1881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387604870
39	NC_017627	TAT	2	6	2017	2022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604870
40	NC_017627	A	7	7	2023	2029	100 %	0 %	0 %	0 %	387604870
41	NC_017627	TCA	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387604870
42	NC_017627	ATA	2	6	2052	2057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387604870
43	NC_017627	TGA	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387604870
44	NC_017627	TAT	2	6	2071	2076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604870
45	NC_017627	GAT	2	6	2093	2098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387604870
46	NC_017627	AGC	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387604870
47	NC_017627	TGA	2	6	2185	2190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387604870
48	NC_017627	TTA	2	6	2256	2261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604870
49	NC_017627	CTG	2	6	2286	2291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387604870
50	NC_017627	A	8	8	2293	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	387604870
51	NC_017627	ATC	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387604870
52	NC_017627	T	7	7	2401	2407	0 %	100 %	0 %	0 %	387604870
53	NC_017627	A	6	6	2498	2503	100 %	0 %	0 %	0 %	387604871
54	NC_017627	CTGTTT	2	12	2520	2531	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	387604871
55	NC_017627	AT	3	6	2532	2537	50 %	50 %	0 %	0 %	387604871
56	NC_017627	ATT	2	6	2554	2559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604871
57	NC_017627	AGA	2	6	2663	2668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387604871
58	NC_017627	GGA	2	6	2674	2679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387604871
59	NC_017627	CTA	2	6	2719	2724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387604871
60	NC_017627	CGG	2	6	2737	2742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387604871
61	NC_017627	TGA	3	9	2788	2796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387604871
62	NC_017627	AT	3	6	2914	2919	50 %	50 %	0 %	0 %	387604871
63	NC_017627	ATG	2	6	2972	2977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017627	ACCAT	2	10	3159	3168	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017627	TCAA	2	8	3197	3204	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017627	TCA	2	6	3295	3300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387604872
67	NC_017627	TAA	2	6	3346	3351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387604872
68	NC_017627	ATGC	2	8	3360	3367	25 %	25 %	25 %	25 %	387604872
69	NC_017627	TCC	2	6	3432	3437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387604873
70	NC_017627	TTA	2	6	3460	3465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604873
71	NC_017627	ATTAT	2	10	3495	3504	40 %	60 %	0 %	0 %	387604873
72	NC_017627	ATCA	2	8	3536	3543	50 %	25 %	0 %	25 %	387604873
73	NC_017627	CCT	2	6	3551	3556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017627	A	6	6	3593	3598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017627	ATT	2	6	3604	3609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017627	CAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017627	CTC	2	6	3681	3686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017627	GCA	2	6	3717	3722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017627	T	6	6	3820	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017627	GCG	2	6	3889	3894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017627	CAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017627	CTGA	2	8	4248	4255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017627	AT	3	6	4355	4360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017627	CA	3	6	4377	4382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017627	ATT	2	6	4390	4395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017627	TA	3	6	4412	4417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017627	TTA	2	6	4426	4431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017627	TA	3	6	4446	4451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017627	TAT	2	6	4535	4540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604874
90	NC_017627	T	7	7	4599	4605	0 %	100 %	0 %	0 %	387604874
91	NC_017627	ATT	2	6	4628	4633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604874
92	NC_017627	GAA	3	9	4670	4678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387604874
93	NC_017627	AT	3	6	4738	4743	50 %	50 %	0 %	0 %	387604874
94	NC_017627	TTCT	3	12	4773	4784	0 %	75 %	0 %	25 %	387604874
95	NC_017627	TTA	2	6	4962	4967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604874
96	NC_017627	ATT	2	6	4985	4990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604874
97	NC_017627	AAGC	2	8	5040	5047	50 %	0 %	25 %	25 %	387604874
98	NC_017627	TCTT	2	8	5127	5134	0 %	75 %	0 %	25 %	387604874
99	NC_017627	AG	3	6	5151	5156	50 %	0 %	50 %	0 %	387604874
100	NC_017627	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387604874
101	NC_017627	AG	3	6	5172	5177	50 %	0 %	50 %	0 %	387604874
102	NC_017627	AG	3	6	5254	5259	50 %	0 %	50 %	0 %	387604874
103	NC_017627	TTTTA	2	10	5320	5329	20 %	80 %	0 %	0 %	387604874
104	NC_017627	AAT	2	6	5374	5379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387604874
105	NC_017627	AGAAA	2	10	5389	5398	80 %	0 %	20 %	0 %	387604874
106	NC_017627	TAA	2	6	5430	5435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387604874
107	NC_017627	TAA	2	6	5478	5483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387604874
108	NC_017627	ATT	2	6	5489	5494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604874
109	NC_017627	T	6	6	5500	5505	0 %	100 %	0 %	0 %	387604874
110	NC_017627	ACA	2	6	5528	5533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387604874
111	NC_017627	TAT	2	6	5657	5662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604875
112	NC_017627	TTTC	2	8	5733	5740	0 %	75 %	0 %	25 %	387604875
113	NC_017627	TAA	2	6	5793	5798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387604875
114	NC_017627	TA	3	6	5851	5856	50 %	50 %	0 %	0 %	387604875
115	NC_017627	AAC	2	6	5857	5862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387604875
116	NC_017627	ACAG	2	8	5884	5891	50 %	0 %	25 %	25 %	387604875
117	NC_017627	TTTA	2	8	5897	5904	25 %	75 %	0 %	0 %	387604875
118	NC_017627	TCT	2	6	5919	5924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387604875
119	NC_017627	ATT	2	6	5972	5977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604875
120	NC_017627	AT	3	6	5982	5987	50 %	50 %	0 %	0 %	387604875
121	NC_017627	GA	3	6	6001	6006	50 %	0 %	50 %	0 %	387604875
122	NC_017627	AAC	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387604875
123	NC_017627	TA	3	6	6013	6018	50 %	50 %	0 %	0 %	387604875
124	NC_017627	A	7	7	6054	6060	100 %	0 %	0 %	0 %	387604875
125	NC_017627	GA	3	6	6082	6087	50 %	0 %	50 %	0 %	387604875
126	NC_017627	TAA	2	6	6099	6104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387604875
127	NC_017627	ATATA	2	10	6171	6180	60 %	40 %	0 %	0 %	387604875
128	NC_017627	A	6	6	6185	6190	100 %	0 %	0 %	0 %	387604875
129	NC_017627	GAG	3	9	6214	6222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387604875
130	NC_017627	GA	3	6	6249	6254	50 %	0 %	50 %	0 %	387604875
131	NC_017627	AG	3	6	6267	6272	50 %	0 %	50 %	0 %	387604875
132	NC_017627	ATT	2	6	6333	6338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604875
133	NC_017627	A	6	6	6349	6354	100 %	0 %	0 %	0 %	387604875
134	NC_017627	GCT	2	6	6367	6372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387604875
135	NC_017627	TTTA	2	8	6416	6423	25 %	75 %	0 %	0 %	387604875
136	NC_017627	ATT	2	6	6525	6530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604875
137	NC_017627	TTC	2	6	6534	6539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387604875
138	NC_017627	ATT	2	6	6559	6564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604875
139	NC_017627	ATT	2	6	6588	6593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387604875
140	NC_017627	GAAA	2	8	6594	6601	75 %	0 %	25 %	0 %	387604875
141	NC_017627	GAT	2	6	6669	6674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387604875
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409	NC_017627	TTG	2	6	18367	18372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387604888
410	NC_017627	ACT	2	6	18388	18393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387604888
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413	NC_017627	GGA	2	6	18636	18641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
414	NC_017627	CTC	2	6	18709	18714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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416	NC_017627	A	6	6	18773	18778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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418	NC_017627	CT	3	6	18850	18855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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421	NC_017627	GAA	2	6	18958	18963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
422	NC_017627	CGT	2	6	19045	19050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_017627	CTG	2	6	19072	19077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_017627	TCG	2	6	19161	19166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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444	NC_017627	ATA	2	6	20310	20315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387604890
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453	NC_017627	AAC	2	6	20941	20946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387604890
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491	NC_017627	TC	3	6	23094	23099	0 %	50 %	0 %	50 %	387604893
492	NC_017627	TTCC	2	8	23199	23206	0 %	50 %	0 %	50 %	387604893
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